MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB03

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017181	TAAA	2	8	38	45	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017181	A	6	6	43	48	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017181	TTC	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017181	AAT	2	6	978	983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017181	TAT	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017181	AAAT	2	8	1059	1066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017181	AAT	2	6	2095	2100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017181	TGA	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017181	ATA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017181	AAG	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017181	AAT	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017181	TAA	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017181	T	6	6	2964	2969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017181	T	6	6	5270	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017181	TAA	2	6	5295	5300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017181	AT	3	6	5341	5346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017181	ATT	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017181	T	6	6	5416	5421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017181	ATAA	2	8	5432	5439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017181	AAT	2	6	5440	5445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017181	TCA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017181	AAT	2	6	6065	6070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017181	CCAT	2	8	6192	6199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017181	T	7	7	6221	6227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017181	GCGT	2	8	6239	6246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017181	CAAT	2	8	6256	6263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017181	TTTG	2	8	6269	6276	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017181	CAT	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017181	GAA	2	6	6369	6374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017181	CT	3	6	6431	6436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017181	GAT	2	6	6512	6517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017181	TA	3	6	8043	8048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017181	TAA	2	6	8058	8063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017181	AGT	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017181	ATC	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017181	A	6	6	8123	8128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017181	TCG	2	6	8133	8138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017181	ATTT	2	8	8141	8148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017181	ATG	2	6	8155	8160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017181	TG	3	6	8159	8164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017181	TCA	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017181	A	6	6	8310	8315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017181	T	8	8	8339	8346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017181	A	6	6	8349	8354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017181	CTC	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017181	ATC	2	6	8493	8498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017181	T	6	6	9289	9294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017181	ACC	2	6	11122	11127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017181	TC	3	6	11134	11139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017181	GCT	2	6	11143	11148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017181	TTTCA	2	10	11265	11274	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017181	T	6	6	11280	11285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017181	TCA	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017181	T	8	8	11330	11337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017181	ATCA	2	8	11393	11400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017181	GCA	2	6	11503	11508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017181	ACC	2	6	11511	11516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017181	ACT	2	6	11536	11541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017181	AATT	2	8	14176	14183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017181	TAT	2	6	14189	14194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017181	A	6	6	14196	14201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017181	TA	3	6	14207	14212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017181	GCT	2	6	14231	14236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017181	ACAA	2	8	14320	14327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017181	CTG	2	6	14358	14363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017181	CAGG	2	8	14388	14395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017181	GAA	2	6	14522	14527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017181	GTC	2	6	14562	14567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017181	GGAA	2	8	14586	14593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017181	AGAA	2	8	14750	14757	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017181	TAGA	2	8	14822	14829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017181	ACC	2	6	14832	14837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017181	A	6	6	14977	14982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017181	ACA	2	6	15076	15081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017181	TAT	2	6	15182	15187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017181	AAT	2	6	18006	18011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017181	AGC	2	6	18084	18089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017181	GTC	2	6	18092	18097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017181	ATC	2	6	18103	18108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017181	A	7	7	18117	18123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017181	CTT	2	6	18139	18144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017181	CCCA	2	8	18250	18257	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_017181	ATAA	2	8	18316	18323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017181	T	6	6	18465	18470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017181	A	6	6	18513	18518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017181	GA	3	6	18519	18524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017181	AAG	2	6	18569	18574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017181	AGA	3	9	18655	18663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017181	CAT	2	6	18669	18674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017181	AGA	2	6	18700	18705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017181	TCT	2	6	18732	18737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017181	CTT	2	6	18756	18761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017181	CTT	2	6	18780	18785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017181	CT	3	6	18801	18806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017181	AAG	2	6	18880	18885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017181	AG	3	6	18922	18927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017181	T	7	7	18931	18937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017181	ACCC	2	8	18961	18968	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_017181	A	6	6	19025	19030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017181	T	7	7	19061	19067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017181	A	6	6	19130	19135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017181	A	6	6	19142	19147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017181	ATC	2	6	19206	19211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017181	ATC	2	6	19296	19301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017181	GTAG	2	8	19832	19839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017181	ATAG	2	8	19894	19901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017181	CAT	2	6	19905	19910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017181	AAGG	2	8	19953	19960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017181	TAT	2	6	20060	20065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017181	ACG	2	6	20107	20112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017181	T	6	6	20122	20127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017181	TGG	2	6	20145	20150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017181	TCT	2	6	20154	20159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017181	AT	3	6	20233	20238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017181	AT	4	8	20285	20292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017181	TTA	2	6	20293	20298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017181	TA	3	6	20316	20321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017181	AAT	2	6	20345	20350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017181	AT	3	6	20349	20354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017181	AT	3	6	21579	21584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017181	GATTA	2	10	21603	21612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017181	AAGT	2	8	21647	21654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017181	ATC	2	6	21714	21719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017181	AGGAT	2	10	21727	21736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017181	ATCCT	2	10	21749	21758	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017181	TGG	2	6	21763	21768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017181	TCC	2	6	25806	25811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017181	GGAT	2	8	29353	29360	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017181	T	6	6	29396	29401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017181	TTA	2	6	31575	31580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017181	AAT	2	6	31660	31665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.